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tvt体育再登Nature子刊生物医学与药学领域共创新突破简直是“神仙打架”!
发布:2023-05-24 21:30:30 浏览:

  tvt体育机器学习可以通过解释抗癌药物协同作用的分子基础来帮助选择抗癌药物的最佳组合。通过将准确的模型与可解释的见解相结合,可解释的机器学习有望加速数据驱动的癌症药理学。然而,由于转录组学数据的高度相关性和高维性,天真地将当前可解释的机器学习策略应用于大型转录组数据集会导致次优结果。在这里,通过使用特征归因方法,我们表明可以通过利用可解释的机器学习模型的集合来提高解释的质量。我们将该方法应用于来自133名急性髓系白血病患者的离体肿瘤样本的46种抗癌药物的285种组合的数据集,并发现了具有治疗协同作用的造血分化特征基础药物组合。根据基因表达数据训练用于预测药物组合协同作用的机器学习模型集合可能会提高复杂机器学习模型的特征归因质量。

  CADD计算机辅助药物设计设计流程,让学员能够掌握包括PDB数据库、靶点蛋白、蛋白质-配体、蛋白-配体小分子、蛋白-配体结构、notepad的介绍和使用、分子对接、蛋白-配体对接、虚拟筛选、蛋白-蛋白对接tvt体育、蛋白-多糖分子对接、蛋白-水合对接、Linux安装、gromacs分子动力学全程实操、溶剂化分子动力学模拟

  AIDD人工智能药物发现与设计课程让学员了解药物发现的前沿背景,学习人工智能领域的各类常见算法,熟悉工具包的安装与使用,掌握一定的算法编程能力,能够运用计算机方法研究药物相关问题。通过大量的案例讲解和实践操作,具备一定的AIDD模型构建和数据分析能力。

  本课程(深度学习基因组学)适于对深度学习、基因组学、转录组学、蛋白组学、药物基因组学等多组学分析感兴趣的学员。课程通过基础入门+应用案例实操演练的方式,从初学及应用研究的角度出发,带大家实战演练多种深度学习模型(深度神经网络DNN、卷积神经网络CNN、循环神经网络RNN、可变自动编码器VAE、图卷积神经网络GCN)在基因组学分析中的各种应用:识别G4基序特征DeepG4,识别非编码基因突变DeepSEA,预测染色体亲和性Basset,预测基因表达eQTL的Enformer、识别拷贝数变异DeepCNV、预测调控因子DeepFactor、预测premiRNA的dnnmiRNA、从基因表达数据中识别乳腺癌分型DeepType、从高维多组学数据中识别疾病表型XOmiVAE、从基因序列及蛋白质相互作用网络中识别关键基因DeepHE、联合肿瘤基因标记及药物分子结构预测药物反应机制的SWnet等深度学习工具。通过对这些深度学习在基因组学中的应用案例进行深度讲解和实操,让学员能够掌握深度学习分析高维基因组学、转录组学、蛋白组学等多组学数据流程,系统学习深度学习及基因组学理论知识及熟悉软件代码实操,熟练掌握这些前沿的分析工具的使用以及研究创新深度学习算法解决生物学及临床疾病问题与需求。

  本课程(机器学习转录组学与表观组学)旨在为学员提供转录组学和表观组学的综合培训,以及在Linux和R环境中进行数据分析的技能。通过本课程,学员将学习如何处理和分析转录组和表观组数据,并深入了解这两个领域的关键概念和最新发展。课程内容包括Linux操作系统的基础知识和常用命令行技巧,R编程语言的应用,转录组数据的预处理和差异表达分析,表观组数据的分析方法,以及综合应用和实际项目实践。

  人工智能与组学的研究到底有多热,以及为何要举办培训,下面的内容给出了答案

  能够快速运用到自己的科研项目和课题上,助力学员发表Nature、Science、Cell等正刊及子刊tvt体育!(在生信分析的新技术加持下,用更少的经费,发更高质量的文章)

  1.人工智能药物发现(AIDD)简介2.机器学习和深度学习在药物发现领域的应用

  复现卷积神经网络CNN识别基序特征DeepG4、非编码基因突变DeepSEA,预测染色体亲和性Basset,基因表达eQTL

  深度学习在识别拷贝数变异DeepCNV、调控因子DeepFactor上的应用

  3.基因序列及蛋白质相互作用网络中识别关键基因的深度学习工具DeepHE

  1.联合肿瘤基因标记及药物分子结构预测药物反应机制的深度学习工具SWnet

  1. 单细胞转录因子(SCENIC)及其细胞通讯(Cellchart)的介绍

  5. 讲解单细胞WGCNA,利用关联共表达找到某些细胞中有关联作用的基因list(这里统一指模块分析)。

  利用PLOS Computational Biology(IF:5分)发表零代码工具,轻松完成差异表达分析,常见统计分析,常见可视化,内置7种机器学习方法,轻松调用。

  利用机器学习基于蛋白组学数据预测表型,基于蛋白组学数据复现cell中机器学习分析结果

  利用机器学习鉴定疾病相关蛋白标志物,基于Olink数据,复现影响因子17分文章中,蛋白数据常规分析+时序蛋白聚类分析+机器学习分析结果

  利用机器学习基于质谱的蛋白质组学数据,构建肝病相关分类和预后模型,复现NatureMedicine文章中的机器学习,生存分析,预后模型相关的结果。

  5. 基于OTU的差异表达分析,热图,箱型图绘制微生物biomarker鉴定

  CADD主讲老师来自国内顶尖药物研究所,老师主要擅长药物虚拟筛选、计算机辅助药物设计、、分子对接、分子动力学等方面的研究、知名金牌授课老师、学员好评率达99.9%!

  AIDD授课老师曹老师,有多年年的计算机算法研究和程序设计经验。研究方向涉及计算机辅助药物设计、机器学习、深度学习、分子毒性预测、图神经网络生化反应。。一作身份发表SCI论文数篇,包括,Journal of Biomedical Informatics, International Journal of Molecular Sciences等知名期刊。

  主讲老师刘老师,生物信息学博士,有十余年的测序数据分析经验。研究领域涉及人工智能tvt体育、自然语言处理、功能基因组学、转录组学、miRNA及靶基因网络分析,单细胞测序数据分析,基因调控网络时序分析,蛋白质互作网络分析,多组学联合分析等。主持省自然科学基金等项目4项,出版医学实用教材《Python医学实战分析》,发表SCI论文22篇,其中一作及并列一作9篇。

  主讲老师来自国内高校陈老师和张老师授课。在国内外学术刊物发表论文数篇,包括Nature Communication, Cell Regeneration等知名期刊,研究方向为生物信息学,发育生物学和遗传学等。利用多组学数据,通过深度学习算法进行数据分析和挖掘,包括ChIP-seq,ATAC-seq,RNA-seq,CNV等。

  机器学习微生物组学与蛋白组学主讲老师来自国内高校李老师授课,有十余年的蛋白质组及微生物组数据分析经验。研究领域涉及机器学习,芯片数据分析,蛋白质组数据分析,DNA,RNA,甲基化测序数据分析,单细胞测序数据分析,miRNA及靶基因分析等,发表SCI论文30余篇,其中一作及并列一作15篇。

  机器学习代谢组学主讲老师来自985高校神经科学博士,主要利用代谢组学、转录组学和分子生物学等技术研究神经内科慢性病的发病机制和生物标志物。擅长高效液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术进行非靶向和靶向代谢组学从样本制备到数据分析的全流程研究,以及多组学大数据的生物信息学整合分析。5年内在J Clin Invest, EBioMedicine, Cell Death Dis, Cell Death Discov, Nanotoxicology等杂志发表SCI论文10篇。

  全国各大高校、企业、科研院所从事人工智能、生命科学、代谢工程、有机合成、天然产物、药物、生物信息学、植物学,动物学、化学化工,医学、基因组学、农业科学、植物学、动物学,临床医学、食品科学与工程、肿瘤免疫与靶向治疗、 全基因组泛癌分析、人黏连蛋白折叠基因组机、病毒检测、功能基因组、遗传图谱、基因挖掘变异、代谢组学、蛋白质组学、转录组学、生物医学、癌症、核酸、毒物学等研究科研人员及爱好者

  3、课程服务答疑--主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供专业解答福利:报名缴费成功赠送报名班型全套预习视频,课后学习完毕提供全程录像视频回放,针对与培训课程内容进行长期答疑,微信解疑群永不解散,参加本次课程的学员可免费再参加一次本单位后期组织的相同的专题培训班(任意一期都可以)

  授课方式:通过腾讯会议线上直播,理论+实操的授课模式,老师手把手带着操作,从零基础开始讲解,电子PPT和教程开课前一周提前发送给学员,所有培训使用软件都会发送给学员,有什么疑问采取开麦共享屏幕和微信群解疑,学员和老师交流、学员与学员交流,培训完毕后老师长期解疑,培训群不解散,往期培训学员对于培训质量和授课方式一致评价极高!

  CADD计算机辅助药物设计;AIDD人工智能药物发现与设计;深度学习基因组学;机器学习转录组学与表观组学;

  机器学习蛋白质组学;机器学习代谢组学;单细胞空间转录组;机器学习微生物组学

  优惠2:提前报名缴费学员+转发到朋友圈或者到学术交流群可享受每人300元优惠(仅限15名)

  证书:参加培训并通过考试的学员,可以申请获得工业和信息化部工业文化发展中心颁发的“工业强国建设素质素养提升尚工行动”岗位能力适应评测证书。该证书可在中心官网查询,可作为能力评价,考核和任职的重要依据。评测证书查询网址:(自愿申请,须另行缴纳考试费500元/人)

  发现真的是脚踏实地的同时 需要偶尔仰望星空非常感谢各位对我们培训的认可!祝愿各位心想事成!

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