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农tvt体育业微生物格局变化:在实验室里烧钱还是在田间地头海选?
发布:2023-04-15 19:38:46 浏览:

  tvt体育近日,《自然·生物技术》再度关注农业微生物领域格局变化,目光投向具备专有技术的小型企业。tvt体育

  我们知道人体内外存在大量微生物,有些和人类是共生关系,参与调控我们的生理状态和免疫能力。

  植物内部、表面和根系土壤中,也天然存在着大量的微生物。它们帮助植物吸收养分,抵抗病虫害,强壮根系,提高产量,以及应对高温、严寒、干旱、盐碱等极端环境的胁迫,即“抗逆”。

  业界为此努力多年。科研人员从自然界采集真菌和细菌,然后在实验室、温室和大田开展测试,施加选择性育种压力,筛选有潜力的菌株。在充分积累表型数据和基因数据的情况下,机器学习可以缩小候选菌株的范围,降低多环境测试的成本。

  最终的微生物制剂,使用方法和农药化肥类似,用作种衣、喷湿叶片,或者撒进土壤。

  过去十年,小型公司为市场生产了最多的产品,涉及的微生物种类广泛,如枯草芽孢杆菌中能够抵御植物病原体的不同菌株,以及土壤中能够改善植物营养和长势的根瘤菌。

  农业巨头多数通过投资、收购或者外包合作的方式,优化在微生物领域的资源配置。

  科迪华新近收购 Symborg 和 Stoller Group,分别是一家西班牙微生物公司和一家美国生物肥料企业。

  拜耳则是另一番操作。2017年,tvt体育拜耳与 Ginkgo 合资成立了Joyn Bio。2022年10月,拜耳宣布完成与 Ginkgo 的生物制品研发基地交易,将位于加州的生物制剂研发基地和平台转让给了 Ginkgo ,合资公司 Joyn Bio 的固氮及研发平台资产也全面整合至 Ginkgo。

  在这笔交易中,拜耳还一并转让了2012年从生物农药公司 AgraQuest 获得的微生物资产。tvt体育作为协议的一部分,拜耳保留了将 Ginkgo 主要候选产品(固氮微生物菌株)以及该管线其他潜在产品商业化的权利。

  拜耳表示已将植物生物制剂的研发重点转向后期。在售微生物产品包括由枯草芽孢杆菌组成的杀菌剂 Serenade 和含有比莱青霉(Penicillium bilaiae)的 BioRise 2。BioRise 2 是微生物种衣剂,可以促进玉米和微生物的共生关系,强壮根系,提高吸收营养的能力。其他生防产品还有防治害虫的脂肪酸和信息素。

  生物农业头部玩家 Bioceres 认为,像拜耳这样的大型集团可能会越来越多地把创新交给较小的公司,自身作为合作伙伴,通过监管和商业化来推广微生物产品。

  这样一来,证明微生物产品效果的工作也转移给了小型公司:意味着从不同地点、环境中生成和采集大量田间试验数据。

  Bioceres 与阿根廷和巴西的数百名种植者达成了试用合作。如果使用效果不佳,Bioceres 给与补偿,这是农业微生物产品拓展用户的通行做法。Pivot Bio 公开数据显示,2021年使用其产品的客户种植面积超100万英亩。Indigo Ag 公开数据显示,其在北美、南美、欧洲和印度累计开展了 2,000 多次田间试验。

  渠道方面,tvt体育Indigo Ag、Pivot Bio 和 Bioceres 都建立了自己的销售体系,面向分销商、零售商和农场主销售产品。

  多说两句 BioCeres。这家传奇公司总部位于阿根廷,在美国纳斯达克上市。育种方面,其HB4转基因抗旱技术独步江湖。公司前身成立于2001年,靠23名农民每人集资600美元启动,后续经过多轮融资,投资者既有孟山都(后被拜耳收购)这样的巨头,也有数百个南美种植大户。

  BioCeres 的微生物产品包括接种剂、生防剂、生物刺激剂。2022年3月,tvt体育BioCeres 与美国 Marrone Bio Innovations 达成全股份合并协议,获得后者农业微生物技术和菌株库。2022年9月,BioCeres 就生物种子处理方案与先正达达成研发及分销合作协议。

  Indigo Ag是个特例。它强调derive from plants, for plants,不对野生菌株进行基因改造,通过广泛的田间种植测试进行实地海选:

  - 每年对数千种菌株进行田间试验评估,找出匹配不同地区、不同作物和环境压力的野生菌株。目前产品组合包含超过 36,000 种菌株。

  - 通过传感器监测植物生长数据和天气、土壤、病虫害信息,从田间试验中挖掘更多的关系数据,结合卫星遥感和机器学习,为种植者提供定制化的微生物方案。

  不涉及基因改造,可以将产品进入不同市场(尤其有机农业市场)的阻力降到最小,同时简化了公众沟通的难度。

  大范围的田间试验本身也有市场示范效应。只有收集充分的功效数据,才能说服种植户和大型农业公司买单。

  ○ 迄今为止,很少有植物性状被归因于单个基因或途径。在微生物组方面,识别参与宿主选择的特定基因同样具有挑战性。

  ○ 考虑抗逆效果显著的菌株不乏采自作物野生祖先者。遗传学层面区分作物和它们的野生祖先之间的微生物群落差异,以及调节这些差异的机制,是另外一重繁重的研究。

  Indigo Ag 的联合创始人 Geoffrey von Maltzahn 也是波士顿知名风投 Flagship Pioneer 的普通合伙人。他在接受Nat. Biotechnol. 采访时说,“我们不得不在复杂的数据科学工具上投入大量资金——远远超过我创办公司时的想象——这样我们才能从较小的实地试验环境中得出真实世界的结论。”

  成熟的微生物表达体系,能否在农业微生物领域基于共生关系的场景中奏效,目前仍有很大的疑问。

  将作物的野生共生菌株驯化成具操作性的遗传表达平台,本身也需面对巨大研发成本和不确定性。

  大量研究表明,微生物组随作物生长阶段会发生巨大的变化。单一或少数菌株能否在整个生长阶段保持稳定尚不明确。

  1. 在实验室中承担成本和风险。需要权衡候选菌株的体量和研发通量,对不确定的技术效果有所预期,以及这种过程本身也将丧失遗传多样性。

  2. 把遗传学的工作交给自然。从自然界广泛收集不同基因型的菌株,再利用统计学工具为它们寻找最适合的场景和施用策略。

  毋庸置疑,人类最终将克服遗传学的难题,人工改造的微生物也将充满农业生产系统,尽管可能是以我们当前所无法想象的方式。

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